В статье рассматриваются методические особенности совершенствования организационной структуры агропромышленного холдинга на основе функционального подхода. Предлагается использование особенностей ключевых компетенций и функционального аутсорсинга. Применение данной методики позволит агропромышленным холдингам перейти от неэффективной организационной структуры управления к гибкой системе реагирования на все изменения внешней среды.